房屋征收补偿协议的主体是房屋征收部门和被征收人。需要强调的是，征收补偿协议的一方主体是市、县级确定的房屋征收部门，而非作出征收决定的市、县级本身。
签订补偿协议是一种法律行为，要求双方当事人应当具有相应的权利能力和行为能力。不具有机关法人资格的工作部门不得被确定为房屋征收部门，不能参与房屋征收法律关系成为补偿协议当事人。
一、签订的房屋拆迁补偿协议可以后悔吗
一般来说，《房屋拆迁补偿协议书》一经签订，房屋拆迁当事人均应全面履行，不允许反悔。但是，由于房屋拆迁涉及的法律关系比较复杂，如果存在以下四种情形，《房屋拆迁补偿协议书》可以反悔。
第
（一）房屋拆迁依托于的行政许可，如果行政许可行为被撤销或确认为违法，据此签订的《房屋拆迁补偿协议书》的合法性就存在问题，当事人可依法请求确认《房屋拆迁补偿协议书》无效。
第
（二）房屋拆迁依托于房屋估价机构的估价行为，如果房屋估价机构不是依法选定的，或者房屋估价机构不依法进行估价，或者房屋估价结果显失公平，当事人可依法请求变更或撤销《房屋拆迁补偿协议书》。
第
（三）协议存在重大误解、显失公平。如果在签订《房屋拆迁补偿协议书》过程中存在其他重大误解、显失公平的情形，存在一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下签订合同的情形。
第
（四）未成年人、行为能力人签定的协议。
二、房屋拆迁补偿合同的诉讼时效是多长
房屋拆迁补偿合同的诉讼时效是六个月。根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条规定，公民、法人或者其他组织直接向人民提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民不予受理。
